立法院在11月18日三讀通過刪除法院組織法第63條之一，正式將特別偵查組廢除。未來特偵組所管轄案件，包括總統、副總統、五院院長等所涉貪瀆案件，將於明年元旦起回歸由各地檢署負責；成立10年的特偵組將在今年底正式熄燈，走入歷史。

提案廢除特偵組的民進黨立委們，主要認為當前特偵組成效不彰、淪為政治工具，但事實上特偵組這10年來的成績，並非一片空白，回顧特偵組設立的本意，筆者忝為立法過程中催生者之一，在制度設計上就是希望給予檢察總長實權，舊制下總長做為全國檢察體系龍頭其實徒具形式，檢察總長所轄最高檢本來有將無兵，真正具有追訴犯罪能量的是高檢及各地檢，而高檢及各地檢的檢察長人事深受法務部影響，對檢察體系對外獨立，對內一體的理念成了一大威脅，這點在謝文定檢察長於高檢署起訴扁案後被突襲式撤換特別凸顯，因此配合總長任命方式改變須經立法院同意一併成立特偵組，讓總長有權也有人。如今特偵組廢除，十年風雨後歷史走回原點，總長再度淪為位高權輕的孤家寡人。

坊間有一說，民進黨此次揮刀砍向特偵組，主要是報特偵組辦扁案之仇，加上忌憚馬英九總統提名的顏大和總長，但如此佈局對司法公正卻有深遠的影響。首先，廢除特偵組後，法務部長和檢察總長對檢察體系的影響力將此消彼長，法務部長與檢察總長的職權分工，一個從事政策制定，一個負責個案，兩人互為犄角又相互制衡，十年來已形成檢察系統運作的共識，如今系統內權力平衡被打破，檢察一體將因此出現破口，法務部主導各地檢察長的調動與升遷，有更大的權力影響檢察體系，整個檢察體系面對權貴有多少作為，都只繫於部長一人的政治風骨，系統風險大增，與國人期待的檢察官獨立辦案目標背道而馳，影響之大，未來有沒有任何機關有勇氣去查緝權貴犯罪，證諸特偵組成立前後經驗讓人不敢樂觀。

其次更重要的，民進黨政府此次用總統的手可伸入特偵組為由，予以廢除，然而廢除特偵組之後，取而代之的是執政者的手透過部長，就可能介入整個檢察體系所有個案，以往是政治人物或財團恐懼執政者有個專門伺候他們的東廠，如今，恐懼的可能變成全民了；解除了權貴的恐懼，卻讓一般人陷入恐懼，筆者無法認同如此不平衡的修法，民進黨政府此次激進的廢除特偵組，若無可以取信國人的做法足以維護檢察一體，恐亦將司法公正隨特偵組一併送進歷史灰燼。